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1. Infection à Helicobacter pylori

Schémas antibiotiques probabilistes

• Première intention (patients naïfs)(Alternative idéale en cas d'allergie aux bêta-lactamines) : Quadrithérapie bismuthée (Pylera®) 10 jours ➤ 3 gélules (4 prises quotidiennes)/jour
• Alternative (résistance clarithromycine ) : IPP 40mg x2/j + Amoxicilline 1g x3/j + Métronidazole 500mg x2/j + Tétracycline 500mg x4/j, 14 jours.
• Deuxième intention : traitement guidé par antibiogramme.

Durée de traitement

Selon protocole.

Agent pathogène fréquent

Helicobacter pylori (bacille Gram-négatif microaérophile).

Facteurs de risque

• Résistance locale à la clarithromycine > 15 %.
• Antécédent d’échec de traitement ou observance insuffisante.

Points clés

• Confirmer la sensibilité par culture ou PCR.
• Assurer une observance ≥ 95 % pour garantir l’éradication.
• Éviter alcool et tabac durant le traitement.

Réf : Toronto Consensus/Maastricht VI 2024.

2. Infection à Clostridioides difficile

Schémas antibiotiques probabilistes

• Première intention : Fidaxomicine 200 mg PO BID × 10 jours.
• Alternative : Vancomycine 125 mg PO QID × 10 jours.
• Cas sévères : Vancomycine 500 mg PO QID × 10 jours.
• Récidives ≥ 2^e :
  • Fidaxomicine « étendu-pulsé » : 200 mg BID × 5 jours → 200 mg QD × 10 jours.
  • Vancomycine schéma dégressif sur 4–6 semaines.

Durée de traitement

10 jours (prolongation possible selon schéma de récidive).

Agent pathogène fréquent

Clostridioides difficile, toxines A/B positives.

Facteurs de risque

• Antibiothérapie récente, hospitalisation.
• Âge > 65 ans, maladie inflammatoire chronique.

Points clés

• Administrer à jeun (1 h avant ou 2 h après les repas).
• Pas d’efficacité de la vancomycine IV.
• Bezlotoxumab ou transplantation de microbiote pour récidives multiples.

Réf : IDSA/SHEA 2021.

3. Péritonite bactérienne spontanée (SBP)

Schémas antibiotiques probabilistes

• Communautaire : Cefotaxime 2 g IV q8h (ou 2 g IV q12h) × 5–7 jours.
• Alternative : Ceftriaxone 1–2 g IV q24h × 5–7 jours.
• Nosocomiale ou risque BMR : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h ou Méropénem 1 g IV q8h.
• Allergie β-lactamines : Ciprofloxacine 400 mg IV q12h ± vancomycine si entérocoques suspectés.

Durée de traitement

5–7 jours, adapter selon réponse clinique.

Agents pathogènes fréquents

Escherichia coli, Klebsiella spp., Streptococcus spp.

Facteurs de risque

• Ascite faible en protéines < 1 g/dL, antécédent de SBP.
• Prophylaxie quinolone, hospitalisation prolongée.

Points clés

• Paracentèse diagnostique (PMN > 250/mm³).
• Albuminothérapie (1,5 g/kg à J0, 1 g/kg à J2) pour réduire risque de HRS et mortalité.
• Répéter la paracentèse si pas d’amélioration à 48 h.

Réf : International Ascites Club 2000; AASLD 2021.

4. Cholangite aiguë

Schémas antibiotiques probabilistes

• Première intention : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h.
• Alternative : Céfépime 2 g IV q8h + Métronidazole 500 mg IV q8h.
• Cas BMR : Méropénem 1 g IV q8h.
• Allergie aux β-lactamines : Ciprofloxacine 400 mg IV q12h + Métronidazole 500 mg IV q8h.

Durée de traitement

7–10 jours après drainage biliaire et contrôle de la source.

Agents pathogènes fréquents

Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterococcus spp., anaérobies.

Facteurs de risque

• Lithiase biliaire, sténose biliaire, cholangiocarcinome.
• Antécédent d’intervention endoscopique (CPRE) ou de pose de prothèse.
• Sepsis ou immunosuppression.

Points clés

• Drainage biliaire urgent (CPRE ou drainage percutané) avant ou en parallèle de l’antibiothérapie.
• Adapter l’antibiothérapie selon l’antibiogramme.
• Soutien hémodynamique et correction des troubles électrolytiques.
• Réévaluer quotidiennement le germe et la réponse clinique.

Réf : Tokyo Guidelines 2018; IDSA 2015.

5. Diverticulite aiguë

Schémas antibiotiques probabilistes

• Non compliquée, immunocompétent : pas d’antibiotique de première intention.
• Si facteurs de risque ou forme compliquée :
  • Ciprofloxacine 500 mg PO BID + Métronidazole 500 mg PO TID, 7–10 jours.
  • Amoxicilline-acide clavulanique 1 g/125 mg PO TID, 7–10 jours.
• Hospitalisation/complications : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h ou Ciprofloxacine IV + Métronidazole IV.

Durée de traitement

7–10 jours (prolonger à 14 si évolution lente).

Agents pathogènes fréquents

Escherichia coli, Bacteroides fragilis.

Facteurs de risque

• Âge > 80 ans, immunosuppression, comorbidités.
• Antécédent de diverticulite compliquée.

Points clés

• Scanner abdominal pour stadification.
• Chirurgie ou drainage si abcès > 4 cm.

Réf : AGA 2023.

6. Pancréatite aiguë nécrosante infectée

Schémas antibiotiques probabilistes

• Première intention : Méropénem 1 g IV q8h ou Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h, 10–14 jours.
• Allergie β-lactamines : Ciprofloxacine 400 mg IV q12h + Métronidazole 500 mg IV q8h.

Durée de traitement

10–14 jours selon réponse clinique.

Agents pathogènes fréquents

Entérobactéries, anaérobies.

Facteurs de risque

• Nécrose infectée confirmée (TDM + FNA).
• Diabète, immunosuppression.

Points clés

• Pas d’antibioprophylaxie en cas de nécrose stérile.
• Drainage percutané si collection > 3 cm.

Réf : AGA 2020.

7. Abcès hépatiques pyogéniques

Schémas antibiotiques probabilistes

• Initial IV : Céftriaxone 2 g IV QD + Métronidazole 500 mg IV q8h, 2–3 semaines.
• Relais oral : Amoxicilline-acide clavulanique 1 g TID ou Ciprofloxacine 500 mg BID + Métronidazole 500 mg TID pour un total de 4–6 semaines.

Durée de traitement

4–6 semaines au total.

Agents pathogènes fréquents

E. coli, Klebsiella pneumoniae, Streptococcus milleri.

Facteurs de risque

• Cholangite, diabète, immunosuppression.
• Traumatisme hépatique ou chirurgie biliaire.

Points clés

• Drainage percutané ou chirurgical nécessaire.
• Suivi radiologique (CT/échographie) jusqu’à résolution.

Réf : Johns Hopkins ABX Guide 2022; NCBI Bookshelf 2021.

8. Diarrhée du voyageur et diarrhée infectieuse

Schémas antibiotiques probabilistes

• Non invasive/modérée : Rifaximine 200 mg TID × 3 jours.
• Sévère ou sanglante : Azithromycine 500 mg QD × 1–3 jours (ou 1000 mg dose unique).
• Adjuvant : Loperamide si pas de fièvre ni de sang.

Durée de traitement

3 jours.

Agents pathogènes fréquents

ETEC, EPEC, EAEC, Campylobacter, Salmonella.

Facteurs de risque

• Voyage en zone tropicale, immunosuppression.
• Consommation d’eau non traitée ou aliments crus.

Points clés

• Réhydratation orale ou IV selon déshydratation.
• Éviter antimotilité en cas de diarrhée invasive.

Réf : CDC Yellow Book 2024; StatPearls 2022.

9. Antibioprophylaxie

Chirurgicale (colorectale)

• Céfazoline 2 g IV 30–60 min avant incision + Métronidazole 500 mg IV si intervention distale.
• Alternatives : Amoxicilline-acide clavulanique 2,2 g IV ou Céfoxitine 2 g IV.
• Ré-dose si durée > 3 h ou perte sanguine > 1500 mL.

Hémorragie variqueuse (cirrhose)

• Céftriaxone 1 g IV QD × 7 jours ou Norfloxacine 400 mg PO BID × 7 jours.

Points clés

• Administrer dans l’heure précédant l’incision ou dès diagnostic de saignement.
• Ajuster doses selon poids et fonction rénale.

Réf : SHC Surgical Prophylaxis 2024; StatPearls 2023.

10. Appendicite aiguë

Schémas antibiotiques probabilistes

• Formes non compliquées :
  • Ertapénem 1 g IV QD × 3 jours
  • Relais oral : Lévofloxacine 500 mg QD + Métronidazole 500 mg TID × 7 jours
  • Alternative orale seule : Moxifloxacine 400 mg QD × 7 jours
• Appendicectomie laparoscopique :
  • Céfazoline 2 g IV (dose unique) 30–60 min avant incision
  • Allergie β-lactamines : Clindamycine 600 mg IV + Gentamicine 5 mg/kg IV
• Formes compliquées (abcès/péritonite) : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h × 4–7 jours, adapter selon contrôle de source.

Durée de traitement

7–10 jours totaux selon évolution clinique.

Agents pathogènes fréquents

E. coli, Bacteroides fragilis, streptocoques du groupe D.

Facteurs de risque

• Immunosuppression, diabète, âge > 60 ans.
• Présence d’abcès ou de péritonite généralisée.

Points clés

• Score Alvarado et imagerie pour diagnostic.
• Échec possible de l’antibiothérapie seule à long terme.

Réf : APPAC JAMA 2015; SHEA 2023.

11. Cholécystite aiguë

Schémas antibiotiques probabilistes (Tokyo Guidelines 2018)

• Grade I–II : Céftriaxone 2 g IV QD + Métronidazole 500 mg IV q8h.
• Alternative : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h.
• Cas BMR : Méropénem 1 g IV q8h ou Céfépime 2 g IV q8h + Métronidazole 500 mg q8h.
• Allergie β-lactamines : Ciprofloxacine 400 mg IV q12h + Métronidazole 500 mg q8h.

Durée de traitement

4–7 jours après drainage ou cholécystectomie.

Agents pathogènes fréquents

E. coli, Klebsiella spp., Enterococcus spp.

Facteurs de risque

• Âge > 70 ans, diabète, obésité.
• Calculs biliaires, antécédent de cholécystite.

Points clés

• Drainage biliaire urgent avant adaptation selon antibiogramme.
• Cholécystectomie laparoscopique précoce si possible.

Réf : Tokyo Guidelines 2018.

12. Gastro-entérite aiguë bactérienne

Schémas antibiotiques probabilistes

• Campylobacter : Azithromycine 500 mg PO QD × 3 jours.
• Salmonella non typhique : Ciprofloxacine 500 mg PO BID × 5–7 jours.
• Shigella : Ciprofloxacine 500 mg PO BID × 3 jours.
• Yersinia : Doxycycline 100 mg PO BID × 7 jours.

Durée de traitement

3–7 jours selon pathogène.

Agents pathogènes fréquents

Campylobacter jejuni, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica.

Facteurs de risque

• Fièvre > 38,5 °C, diarrhée sanglante, terrain vulnérable.
• Voyage, immunosuppression.

Points clés

• Hydratation rigoureuse.
• Éviter antimotilité si diarrhée invasive.

Réf : NCBI PMC 2019.

13. Infection sur sonde de gastrostomie

Schémas antibiotiques probabilistes

• Infection locale : Ciprofloxacine 500 mg PO BID + Métronidazole 500 mg PO TID × 7–10 jours.
• Péritonite : Piperacilline-tazobactam 4,5 g IV q6h + ablation de la sonde.

Durée de traitement

7–14 jours selon gravité.

Agents pathogènes fréquents

Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, anaérobies.

Facteurs de risque

• Soins de la sonde déficients, immunosuppression.
• Long séjour hospitalier.

Points clés

• Nettoyage quotidien du site.
• Remplacement de la sonde si infection sévère.

Réf : ECE 2023.

14. Colite à CMV chez immunodéprimé

Schémas antiviraux probabilistes

• Première intention : Ganciclovir IV 5 mg/kg Q12h × 2–3 semaines.
• Relais oral : Valganciclovir 900 mg PO BID × 3–6 semaines selon réponse endoscopique.
• Alternative (résistance) : Foscarnet IV 60 mg/kg Q8h ou 90 mg/kg Q12h.

Durée de traitement

3–8 semaines selon réponse endoscopique et immunitaire.

Agent pathogène

Cytomégalovirus (CMV).

Facteurs de risque

• Transplantation d’organe, SIDA, chimiothérapie.
• Lymphopénie, neutropénie.

Points clés

• Surveiller NFS et fonction rénale.
• Ajuster dose en cas d’insuffisance rénale.

Réf : NIH HIV OI Guidelines 2021; StatPearls 2022.

15. Amibiase intestinale et abcès hépatique amibien

Schémas antiparasitaires probabilistes

• Infection intestinale : Métronidazole 750 mg PO TID × 10 jours ou Tinidazole 2 g PO QD × 3 jours, puis relais luminal par Paromomycine 25 mg/kg/j en 3 prises × 7–10 jours ou Iodoquinol 650 mg TID × 20 jours (CDC 2024).
• Abcès hépatique amibien : Métronidazole 750 mg PO TID × 10 jours + relais luminal Paromomycine 25 mg/kg/j en 3 prises × 7–10 jours. Drainage si non réponse ou risque de rupture.

Durée de traitement

10–20 jours selon localisation et réponse clinique.

Agent pathogène

Entamoeba histolytica (protozoaire invasif).

Facteurs de risque

• Zones tropicales d’endémie, ingestion d’eau ou aliments contaminés.
• Voyage prolongé, conditions sanitaires précaires.

Points clés

• Différencier E. histolytica de E. dispar par PCR ou antigénique.
• Drainage abcès uniquement si complications (rupture, hémorragie).
• Prévention par hygiène, traitement des porteurs asymptomatiques.

Réf : CDC Yellow Book 2024; OMS 2017.

16. Giardiose

Schémas antiparasitaires probabilistes

• Métronidazole : 500 mg PO TID × 5–7 jours.
• Tinidazole : 2 g PO dose unique.
• Nitazoxanide : 500 mg PO BID × 3 jours.
• Alternatives : Furozolidone 200 mg PO BID × 5–7 jours ou Paromomycine 25 mg/kg/j en 3 prises × 5–10 jours.

Durée de traitement

3–7 jours selon schéma choisi.

Agent pathogène

Giardia duodenalis (protozoaire flagellé).

Facteurs de risque

• Ingestion d’eau non traitée, voyage en zone endémique.
• Immunosuppression, contact eau de loisirs (piscines, lacs).

Points clés

• Confirmer par examen parasitologique de selles (PCR, EIA).
• Hydratation orale/IV en cas de diarrhée sévère.
• Prévention : hygiène des mains, éviter eau suspecte.

Réf : CDC Yellow Book 2024; CDC HCP Guidance 2023.

17. Cryptosporidiose

Schémas antiparasitaires probabilistes

• Nitazoxanide : 500 mg PO BID × 3 jours (patients immunocompétents).
• Support : réhydratation, contrôle électrolytique.

Durée de traitement

3 jours, prolonger si persistance chez immunodéprimés.

Agent pathogène

Cryptosporidium spp. (protozoaire intracellulaire).

Facteurs de risque

• Immunodépression (VIH, chimiothérapie), jeune âge.
• Exposition à eau contaminée (piscines, eaux de puits).

Points clés

• Importance de l’hygiène et filtration de l’eau.
• Les immunodéprimés peuvent nécessiter traitement prolongé.

Réf : CDC Cryptosporidiosis Treatment 2024; FDA 2023.

18. Strongyloïdose

Schémas antiparasitaires probabilistes

• Ivermectine : 200 µg/kg PO QD × 2 jours (infecté chronique/non compliqué).
• Alternative : Albendazole 400 mg PO BID × 7 jours.
• Hyperinfection/disséminée : Ivermectine 200 µg/kg PO QD jusqu’à 2 semaines après négativité copro.

Durée de traitement

2–7 jours, prolonger en cas de formes sévères.

Agent pathogène

Strongyloides stercoralis (nématode intestinal).

Facteurs de risque

• Zones tropicales, marche pieds nus en sol contaminé.
• Immunosuppression (corticoïdes, VIH, HTLV-1).

Points clés

• Dépistage par sérologie + coproconcentration multiple.
• Surveillance NFS, fonction hépatique et rénale.

Réf : CDC Yellow Book 2024; CDC Refugee Guidelines 2024.

19. Schistosomose intestinale et urinaire

Schémas antiparasitaires probabilistes

• Praziquantel : 40 mg/kg PO dose unique (20 mg/kg BID) pour S. mansoni, haematobium.
• Schistosoma japonicum : 60 mg/kg PO en 3 prises sur 1 jour.
• Reprise : si sérologie positive à 6–8 semaines.

Durée de traitement

Dose unique, réévaluer sérologie à 6–8 semaines.

Agent pathogène

Schistosoma spp. (trematodes).

Facteurs de risque

• Contact eau douce stagnante en zones tropicales.
• Activités récréatives ou professionnelles (pêche, agriculture).

Points clés

• Dépistage sérologique ou examen parasitologique des selles/urines.
• Mass Drug Administration (MDA) en populations à risque.

Réf : WHO Schistosomiasis Fact Sheet 2023; CDC 2024.